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      攜手Moderna與勃林格殷格翰,IBM重回醫(yī)療

      馮汝梅2023-12-03 08:49

      11月28日,勃林格殷格翰和IBM宣布達成一項合作協(xié)議,勃林格殷格翰將能夠利用IBM的基礎模型技術來發(fā)現(xiàn)新型候選抗體,用于開發(fā)有效的治療方法。 

      根據(jù)協(xié)議,勃林格殷格翰將使用IBM開發(fā)的預訓練人工智能模型,該模型將根據(jù)勃林格殷格翰的其他專有數(shù)據(jù)進行進一步微調(diào)以生成目標候選抗體。 

      勃林格殷格翰生物治療藥物研發(fā)全球主管Andrew Nixon表示,“雙方合作將開發(fā)出一個前所未有的加速抗體發(fā)現(xiàn)的平臺,加速公司創(chuàng)造新抗體療法的步伐。”

      建立在超11億個分子基礎上的MoLFormer

       治療性抗體是癌癥、自身免疫性疾病和傳染病等疾病治療的核心,但是覆蓋不同表位的治療性抗體的發(fā)現(xiàn)和開發(fā)是一個高度復雜且耗時的過程。而人工智能(AI)和深度學習正在改變抗體藥物研發(fā)的多個方面,其中,AI正在逐漸影響到更為復雜的層面——抗體的設計和優(yōu)化。 

      而此次勃林格殷格翰與IBM的合作將為其抗體研發(fā)裝上“加速器”。在雙方合作基礎上,林格殷格翰和IBM研究人員將共同致力于通過IBM基礎模型技術,提高抗體發(fā)現(xiàn)的速度和效率以及預測候選抗體的質量。 

      勃林格殷格翰“信任”IBM的原因在于,IBM此前發(fā)布了一個能夠有效篩選并生成新分子的模型——MoLFormer。 

      MoLFormer是一種預訓練的AI模型,它在2個公共化學數(shù)據(jù)庫——PubChem(包含約1億個分子)和ZINC(包含約10億個分子)中,以自監(jiān)督的方式預訓練基于Transformer神經(jīng)網(wǎng)絡的模型,學習有效和低維的化學分子表征。而后通過對任務特定數(shù)據(jù)的微調(diào),將模型以遷移學習的方式,應用于不同的下游分子性質預測任務、計算分子相似性,以及分析給定分子的原子間空間距離和注意力值之間的對應關系。 

      簡單來說,MoLFormer可以預測分子的物理特性(如溶解度)、生物物理特性(如抗病毒活性)、生理特性(如穿過血腦屏障的能力)以及量子特性(如分子的帶隙能量)等。此外,MoLFormer還可用作解碼器,生成具有所需特性的新設計的蛋白質和小分子。 

      在實際研發(fā)中,IBM與其合作伙伴將形成一個循環(huán)通路。以勃林格殷格翰為例,首先,IBM通過MoLFormer等基礎模型技術為勃林格殷格翰篩選出目標候選抗體;隨后,在驗證步驟中,勃林格殷格翰將小規(guī)模生產(chǎn)候選抗體,并通過實驗評估該候選抗體。 

      最后,實驗室實驗的結果將會被用來通過反饋回路來改進計算機模擬方法,然后IBM根據(jù)其提供的特定專有數(shù)據(jù)對預訓練模型進行微調(diào),最終提供具有所需屬性的新設計的目標抗體。

      棄療2年后,憑AI和量子計算再戰(zhàn)醫(yī)療

      在勃林格殷格翰前,IBM已與克利夫蘭診所(Cleveland Clinic)和Moderna就醫(yī)療保健研究和生物醫(yī)藥研發(fā)方面達成了合作。 

      2023年4月,IBM和Moderna簽署了一份合作協(xié)議,雙方將AI和量子計算納入mRNA療法的開發(fā),以加速設計出具有最佳安全性與有效性的mRNA藥物。 

      根據(jù)協(xié)議,Moderna將參加IBM量子加速器項目和IBM量子網(wǎng)絡,IBM將提供量子計算系統(tǒng)的訪問權限以及Moderna所需的專業(yè)知識,以推動Moderna探索由量子技術驅動的生命科學領域的前沿應用。此外,Moderna還將使用MoLFormer來了解潛在mRNA 藥物的特征,并設計一類新的疫苗和療法。 

      2023年3月,IBM和克利夫蘭診所正式公布在美國部署的醫(yī)用量子計算機。安裝在克利夫蘭診所的IBM Quantum System One將成為世界上第一臺專門用于醫(yī)療保健研究的量子計算機,它將幫助克利夫蘭診所優(yōu)化醫(yī)療保健的復雜系統(tǒng)并加速生物醫(yī)學發(fā)現(xiàn)。 

      此次部署建立在IBM和克利夫蘭診所此前達成的一項合作的基礎上。2021年3月,IBM和克利夫蘭診所宣布了一項為期10年的合作計劃,共同建立一個名為Discovery Accelerator的設施,旨在通過在混合云、AI和量子計算技術上使用高性能計算,從根本上推進醫(yī)療保健和生命科學領域的發(fā)現(xiàn)速度。  

      通過Discovery Accelerator,研究人員計劃使用先進的計算技術生成和分析數(shù)據(jù),以幫助克利夫蘭診所的全球病原體研究和人類健康中心,在基因組學、單細胞轉錄組學、人口健康、臨床應用以及化學和藥物發(fā)現(xiàn)等領域開展研究工作。 

      自安裝量子計算機以來,克利夫蘭診所已經(jīng)啟動了9個量子計算項目,這些項目包括:開發(fā)量子計算管道,篩選和優(yōu)化針對特定蛋白質的藥物;改進非心臟手術后心血管風險的量子增強預測模型;應用人工智能搜索基因組測序結果和大型藥物目標數(shù)據(jù)庫,以尋找有效的現(xiàn)有藥物,幫助阿爾茨海默氏癥和其他疾病患者。 

      不過,就在IBM宣布和克利夫蘭診所合作的前一個月,IBM正在考慮拆分旗下Watson Health業(yè)務。2022年1月,IBM將Watson Health出售給總部位于舊金山的投資基金Francisco Partner。 

      Watson Health是IBM花數(shù)十億美元在醫(yī)療保健領域打造的一個業(yè)務板塊,它主要利用AI幫助醫(yī)院、保險公司和制藥商管理數(shù)據(jù),并提供癌癥治療解決方案,以輔助全球各地的醫(yī)生對患者進行診治。 

      “成為真正的AI醫(yī)生”是IBM開發(fā)Watson Health的目標,IBM希望通過Watson Health制霸未來的醫(yī)療AI市場。在推出Watson Health之時,IBM放出了“人類將會被取代”的豪言,并大力鼓吹它能夠應用于擁有豐富多樣語言的醫(yī)療、金融、法律和學術界。時任IBM的CEO Virginia Rometty也表示,這是IBM的“登月計劃”、是IBM的戰(zhàn)略任務之一。 

      但事與愿違,Watson Health沒有成為“將給醫(yī)學界帶來革命性改變的旗艦性產(chǎn)品”,反而成為IBM進軍AI醫(yī)療領域的敗筆。 

      “沒有真正用上AI”成為Watson Health失敗的核心原因之一,IBM并未將其在宣傳中所強調(diào)的AI技術整合到Watson Health產(chǎn)品中。領導打造Watson團隊的David Ferrucci博士曾表示,“Watson的設計功能是識別單詞模式,預測問答游戲正確答案,它并不是一個可以用于商業(yè)領域的萬能解答器,它很可能在二年級閱讀理解測試中不及格。” 

      作為IBM在AI醫(yī)療領域最早最大的嘗試之一,Watson Health最終以失敗告終。 

      不過,IBM并沒有“一蹶不振”,而是重整旗鼓再戰(zhàn)AI醫(yī)療。 

      這一次,IBM一改此前“單打獨斗”的方式和理念,通過尋求醫(yī)療領域內(nèi)具有超強實力和醫(yī)學背景知識的合作伙伴布局AI醫(yī)療領域,利用自身的AI和量子計算技術賦能創(chuàng)新藥企,幫助企業(yè)解決醫(yī)療保健和醫(yī)藥研發(fā)中棘手的問題和挑戰(zhàn)。 

      從克利夫蘭診所到勃林格殷格翰,IBM正在逐漸擴大其在醫(yī)療領域的商業(yè)版圖。這一次,IBM能否成功在醫(yī)療領域占有一席之地,我們拭目以待!


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